1、开发区中心园区东至京九铁路、西至220国道、南至庄青路、北至220国道，面积约17.73平方公里。园区功能定位为对接菏泽发展产城融合型新城区，展现曹县特色的高品质城市区域主导产业包含轻工业和纺织产业、橡胶轮胎制造、农副产品深加工、智能设备制造四大类，以百隆纺织、尚威医疗、巨鑫源、正道轮胎、凯旋橡胶、三利轮胎等为龙头企业。园区区位优势明显，道路交通便利，主体功能健全，基础配套与公共服务设施完善，主导产业明显，新兴产业突出，特色资源丰富，发展空间广阔。园区依托县城，辐射周边，可形成一、二、三产业协调发展、城乡高度统筹、产城充分融合的综合性功能区。
2、开发区北部园区位于东鱼河南支南邻、青菏北路两侧，东至工业三路、西至顺河路、南至曹达古风企业南侧、北至东鱼河南支，规划面积约8.23平方公里。化工园区功能定位重点发展精细化工，适度发展基础有机化工，少量发展资源回收利用产业，倾力打造现代化创新型绿色生态示范区，以圣奥化工、格得生物科技、和源化学、东合新能源LNG调峰储备站、菏泽科腾生物科技为龙头企业，配套设施完善，热力、天然气、自来水、污水管网已铺设完成，拥有已建成投产的污水处理厂、供热公司、危化品洗车停车场；中小企业孵化园功能定位培育壮大中小企业为核心的多功能综合性园区，以木质工艺品加工为主，新润工艺、艺都工艺为龙头企业，2015年9月园区被命名为“省级创业示范园区”；智慧家居产业园功能定位智慧居家制造为主题，紧密结合工业4.0和互联网物联网技术，致力于构建品牌价值与区域价值双提升的新旧动能转换示范标杆园区，代表性企业有睿帆工艺、初林工艺品、雅而美家居等。光电产业产业园功能定位光电设备制造与研发从而促成光电产业上中下游产业有效联动、共同发展的良性循环，代表性企业有科敏传感器、盛达鑫光电、飞翔达光电、迈睿达科技。潮源服饰产业园拥有菏泽潮源服饰、星代兰（山东）卫生用品、园凡新型材料等新型制造企业。
3、开发区东部园区位于京九铁路以东、迎宾大道两侧，东至曹县晋江产业园、西至京九铁路、北至磐石纺织工业园、南至园区规划路，规划面积约7.72平方公里。园区功能定位为特色鲜明、开发集约、产业集聚、创新服务的多功能产业集聚区，新的经济增长点策源地。主导产业包含传统产业制造（铁艺品、卫生材料、棺木等）、机电装备制造、电子商贸物流、新医药四大类，广源陆港物流项目、鑫齐药业、韩升元电子、威肯叉车为龙头企业，新兴产业有电商孵化基地E裳小镇，园区跨越迎宾大道，道路交通便利，配套基础设施齐全，产业发展优势明显，园区内生态环境良好，土地储备充裕，发展空间广阔，主导产业明显，战略性新兴产业凸起，2018年10月，园区“科技企业孵化器”和“众创空间”两个发展平台由省科技厅备案授名。通过持续深度开发建设，园区必将打造成为科技领先高地、企业家创新创业沃土。
4、家具联盟产业园位于庄寨镇、庄青路南侧，东至经十一路、西至经一路、北至纬一路、南至纬十一路，规划面积约2.10平方公里。产业园功能定位为依托当地深厚的林木产业基础优势，为加快新旧动能转换，推动产业转型升级，不断培育新的经济增长点。整个园区划分为家具制造区、家具制造配套区、集中供热区、综合服务区四大板块，可容纳50余家企业入驻，辐射带动周边群众就业3万人，已入驻企业20余家，园区发展战略定位为鲁西南最大的家具研发生产基地。
5、毛纺服装产业园位于王集镇政府驻地东南、许单公路两侧，东至规划三路、西至张仝路、南至工业五路、北至工业路，规划面积约1.02平方公里。产业园功能定位为围绕当地民族毛纺特色资源优势，加快毛纺产业转型发展，园区集洗毛、碳化、梳绒梳条、纺织织布、服装加工于一体，突出创新链、产业链、服务链、财税链交织融合。整个园区设生产加工区、办公服务区、商贸物流区、供热供气中心、光电产业区五大板块，铺设三纵五横八条主干道路，可容纳40余家企业入驻，辐射带动周边群众就业5000人，园区发展战略定位为富有民族气息的现代化毛纺服装产业基地。
6、复程工业园位于位于青堌集镇政府驻地东北、德商公路两侧，东至工业东路、西至工业西路、北至朱牌坊村南邻、南至中腾制粉厂，规划面积约1.45平方公里。工业园功能定位为发挥当地养殖种植业优势，聚集全县所有食品加工企业集中发展，建设高档食品加工园区，代表性企业有曹县牧原肉食品有限公司、山东派森食品有限公司。园区配套设施较为完善，拥有高低压线路专线，8条主干道路已修建完成，日处理1.5万吨的污水处理厂正在调试运行，雨污管网正在建设完善中。园区发展战略定位为鲁西南周边最大、品类最齐全、配套最完美的食品研发生产基地。