保税加工
综合保税区内生产企业可从事国外进口原材料保税加工后出口（或销往国内），或从国内采购原材料入区退税后加工出口。保税加工功能为利用国内外两种资源、产品面向国际、国内两个市场的生产企业提供了政策凹地。
保税物流
综合保税区可为区内外进出口企业在采购原材料、产品销售的过程中，为其提供货物保税状态下的仓储、配送、增值加工、国际中转、进口复出口等物流服务，货物仓储无存储期限，能够利用最低的物流成本，实现企业的利润最大化。
货物贸易
综合保税区内企业均享有进出口经营权，可从事全球或地区性采购、分销、配送业务。对入区的货物，可进行进出口集运的综合处理或商业性的增值加工，包括分级分类、分拆分捡、分装、加刷唛码等。
服务贸易
在综合保税区内从事与保税加工、保税物流、货物贸易相关的研发设计、产品检测、售后维修、设备租赁等服务贸易业务，可设立国际研发中心、检测维修中心、营销结算中心及融资租赁中心。
虚拟口岸
利用青岛机场和青岛港口的国际交通枢纽资源，采用一体化直通业务模式，将口岸功能延伸后移到潍坊综合保税区，等同于在潍坊综合保税区设立了“无跑道国际机场（虚拟机场）”和“无水国际码头（虚拟码头）”。原来进出口货物需到青岛口岸办理的通关手续，现在通过综合保税区即可办理，不需再到青岛办理。